Ha így oltják ki valakik életét, akkor az a Biblia szerint nem számít gyilkosságnak, mert csak a büntetésüket kapták meg?

Az Ószövetséget azért hagyták meg, mert egyrészt a keresztény egyházak történelméhez hozzátartozik (a magyar történelemben is vannak csúfos részek, mégsem vesszük ki őket a történelemkönyvekből), másrészt az Ószövetségnek vannak a mai napig is "hatályos" részei, hiszen az nem csak a törvénykönyvből, hanem több egyéb részből áll - történelmi, irodalmi stb.

"de mégis megtették. pl. a keresztes háborúk idején, de csomó más eset is van ):"

Igen, mint már írtam, valóban megtették, amiért II. János Pál pápa 2000-ben, a nagyböjt első vasárnapján tartott szentmise keretében bocsánatot kért az Úrtól és az érintett emberektől is a katolikus egyház a múltban és a jelenben elkövetett összes eddigi bűneiért. A pápa a katolikus egyház az "igazság szolgálatában" elkövetett bűneiért, többek között az inkvizíció, a kereszteshadjáratok és a katolikus egyház zsidóellenes cselekedeteiért kért bocsánatot.

de mégis megtették. pl. a keresztes háborúk idején, de csomó más eset is van ):