A gelelektroforezisnel hogy mukodik az eredmenyek kiertekelese?

A gélelektroforézis lényege a következő: az egyes molekulák töltésük szerint vándorolnak az ellentétes pólus felé. A DNS negatív töltésű (foszfát csoport miatt), ezért a + irányba megy. Mivel gélbe futtattátok a DNS-t ezért a kisebb-nagyobb DNS darabok más-más sebességgel mozogtak. A 300 és 600 bp a DNS mérete. Ezek ismert méretű DNS darabok, ezek segítségével lehet az ismeretlen DNS méretét megállapítani (meddig futott).

A DNS alapból nem látszik, egy speciális festék miatt látod az UV alatt.

Ideális esetben az elektroforézis során az töltéssel rendelkező molekula vándorlási sebességét csak a tömegegységre jutó töltés befolyásolja (tehát ELVILEG minden DNS molekulának ugyanott kellene futnia), ámde, ezt számos egyéb tényező befolyásolja, amiből a leglényegesebb az eletroforetizált anyag és a gél szerkezetének kölcsönhatása.

A hosszabb DNS vándorlását a gél szerkezete lassítja. (minél hosszabb létrával próbálsz keresztülmenni egy erdőn, annál lassabban tudsz haladni pláne, ha a létra össze-vissza tekereg, mint a DNS). Tehát a 300bp-s DNS szakasz gyorsabban megy, mint a 600bp-s (1%-os agaróz gélen, standard puffer rendszer alkalmazása esetén).

Persze létezik olyan kis méretű DNS, amire már ez a hatás nem jelentős, és minden ennél a méretnél kisebb DNS kb ugyan ott fut, illetve létezik olyan hosszú DNS, ami már annyira hosszú, hogy egyátalán nem lép be a gélbe. A standard 1%-os agaróz felbontása olyan 200bp-10kbp között van.