Az RFLP -nek mi a lényege? A (pl. genomi) DNS -ünket egy, vagy több restrikciós enzimmel kezeljük? Miért jó ez nekünk?

Tegyuk fel, hogy van egy szakasz a genomban, ami igy nez ki: GAATGC

Namost ha ez elmutalodik ugy, hogy GAATTC lesz belole (a masodik G-bol T), akkor hasitani fogja az EcoRI nevu restrikcios enzim. Nyilvan ez az enzim szaz masik helyen is hasitja az adott DNS-t, aminek emiatt egy adott hasitasi mintazata van. De ez az extra hely egy masik mintazatot fog eredmenyezni. (Forditva is megy a dolog: eredetileg GAATTC hely mutalodik valami massa.)

Nyilvan nagyon nagy genomra ennek nem sok haszna van, mert a hasitasi kep nem elkulonult csikokbol all, hanem egy elmosodott masszabol. Illetve ilyenkor az RFLP-t ugy lehet eszlelni, ha elobb PCR-rel amplifikaljuk az adott szakaszt, majd megemesztjuk.

A DNS fingerprint az nem polimorfizmus. Ott azt vizsgaljak, hogy egy adott feherje hova tapad a DNS-en. Tegyuk fel, kivancsi vagy, hogy egy adott DNS koto feherje pontosan melyik DNS szakaszt szereti megkotni. Fogod a DNS-t, osszekevered a feherjevel majd elkezded valamivel megemeszteni. Ez nem csak restrikcios endonukleaz lehet, hanem barmi, akar exonukleaz is.

Ahol a vizsgalt feherje koti a DNS-t, ott a nukleaz nem tudta szetszedni azt. Igy csak olyan DNS darabjaid maradnak, amiket a feherje kot. Szoval valahogy leszeded a feherjet a DNS-rol (mondjuk denaturalod), es megszekvenalod az egyben maradt DNS-eket. Ez lesz az adott feherje fingerprintje.