Az enzimek baromi nagyok és pici a kötöfelület, hogyhogy nem baromi kicsi a kötési valószínűség?

Nem hülyeség amit kérdezel. Igazából nem a kötési valószínűséget kell nézni összesen, hanem a kötési időt, azaz azt az időt ami eltelik míg megtalálják egymást. (Hiszen emiről beszélünk az nem az összes valószínűség, hanem annak a valószínűsége, hogy adott idő, mondjuk 1 milliszekundumon belül létrejöjjön a kapcsolat), vagyis 1 szekundum alatt már 1000-szeres valószínűséged lesz.) Ilyen módon egy nagyon nagy enzim nagyon kicsi zsebbel azt eredményezi, hogy sokáig tart míg rátalál a szubsztrát. Ez pedig igazából oda vezet, hogy lassú lesz a reakció, de előbb-utóbb megtalálják egymást. (Az össz reakció sebességet tudjuk mérni.)

A biológia erre találta ki azt, hogy ahol gyors reakciók sora kell (mármint egy adott molekulát átmeneti alakokon kersztül alakít át több enzim), ott a reakciót végző enzimek térben egy helyen helyezkednek el, egymásnak adogatják a szubsztráto. Így a szubsztrát lokális koncentréciója igen nagy lesz.