Mire jó a gélelektroforézis?

Fehérjék méret szerinti elválasztására.

Illetve DNS, RNS elválasztására is jó. A lényeg az, hogy a fehérjéket denaturálni kell, SDS-sel, és akkor mindnek egységes negatív töltése lesz, így a pozitív elektróda felé vándorolnak a gélben. A gél lehet agar vagy akrilamid, az elválasztandó molekula méretétől függően. A nagyobb molekulák jobban elakadnak a gélben, ezért lassabban futnak, a kisebb molekulák pedig nagyobb utat tesznek meg.