Miért nem jó ez a JavaScript+PHP kód együtt?

A kódodból

document.getElementById("seconds").innerHTML = "<?php header("Location: oldal.php")?>";

Ez így nem fog menni. A html header már el lett küldve, a js ezért futhat, így ez soha nem fog megvalósulni.

A fenti sort egyszerűen cseréld le:

self.location = "oldal.php";

Ja igen: arról nem is beszélve, hogy a php utasításokat a szerver fordítja a böngészőnek, így nem variálhatod a html tartalmat php utasításokat beszúrva.

Nézz utána az ajax módszernek, ha ilyesmit szeretnél. (jQuery-t javaslom az ajaxhoz, kicsit egyszerűbben hívható mint a natív)

Először tisztázni kell fejben, hogy a PHP kód a szerver oldalon fut, míg a JavaScript a kliens oldalon (most a Node.js-től tekintsünk el).

Egy szóval a PHP kód végrehajtódik és az így generált tartalmat adja át a szerver a böngészőnek, hogy jelenítse meg. Mivel PHP-ban elvégzel egy átirányítást, a szerver szól a böngészőnek, hogy "máshol keresse" a tartalmat és a JavaScript és az egész HTML kód, amely ezután kiküldésre kerülne sosem jut el a böngészőhöz.