Hogy lehet, hogy a magyarban a "szankcionál" szó tiltást, büntetést jelent, míg eredetileg a latin szó azt jelenti, hogy "szentesít", tehát pont az ellenkezőjét?

Izgalmas a kérdés. Ha tudsz angolul itt ugyanezt fejtegetik:

[link]

Technikailag arról van szó, hogy a törvényeket is szentesítették. S az emberek elkezdték ezt használni "Ha balhézol kapsz egy szentesítettet!". Tehát ez kapcsolat, hogy a szentesítés ugye összekapcsolódott a törvényekkel, s innen egy lépés, hogy a büntetésekkel majd megszorításokkal álljon össze.

Hogy lehet? Talán úgy, hogy a szankció szó nem jelentette sosem azt, hogy szentesít.

sanctio valamely törvény büntető cikke

De a megfelelő ige (sancio) szentesít jelentéséből következőleg a latinban használatban az is benne van, hogy szentesített törvény szerinti büntetés terhe mellett tiltja, vagy a büntetést kapja