A fehérjék/proteinek alakját mi befolyásolja?

Az aminosav az alábbiakból áll:

-aminocsoport

-karboxilcsoport

-oldallánc

A fehérjék úgy jönnek létre, hogy az aminosavak karboxil- és aminocsoportjai peptidkötéssel csatlakoznak egymáshoz.

Viszont a (nem szomszédos) aminosavak oldalláncai is interrakcióba léphetnek egymással, persze a peptidkötésnél gyengébb módon: hidrogénkötéssel, diszulfid híddal, ún. "sóhíddal", van der Waals kölcsönhatásokkal. Befolyásolja a szerkezetet a víz hidrofil / hidrofób kölcsönhatásokkal. Vagy lehet szó egyes esetekben konformációs változásokról.

Bővebben: Lásd fehérje elsődleges / másodlagos / harmadlagos / negyedleges szerkezete interneten vagy kémiakönyben.

Az aminosavsorrend (elsődleges szerkezet) mellett beszélhetünk másodlagos, harmadlagos és negyedleges szerkezetről a fehérjék esetében.

A másodlagos szerkezet akkor alakul ki, ha a szomszédos aminosavak között hosszabb szakaszon ugyanakkora szög van. Ezt a peptidközések közötti hidrogénkötések stabilizálják. Például a hemoglobin szerkezetében elég sok alfa-hélix van.

A harmadlagos és negyedleges szerkezetet (ahogy az első válaszoló írta) az oldalláncok közötti kölcsönhatások stabilizálják. (A harmadlagos szerkezet a teljes peptidlánc térbeli rendeződése, a negyedleges szervezet a peptidláncok egymáshoz viszonyított helyzete.)

"miért nem valahogyan szabályosabban tekeredik össze?"

Ha egyszerűbb (szabályosabb) szerkezetűek lennének, a legtöbb fehérje nehezen látná el a funkcióját. (Amúgy a szerkezeti fehérjék például általában elég egyszerű térszerkezetűek.)

"entrópikus alakot öltenek fel"

Az milyen?

"A telomeráz enzim?"

A telomeráz enzim a DNS láncvégi védőszakaszokat (telomereket) tudja meghosszabbítani. Az égvilágon semmiköze ehhez.

"Vagy egyéb külső faktorok, pl érfalak nyomása?"

??

A fehérjék a sejteken belül képződnek. Annyi igaz, hogy a szerkezetüket a környezeti tényezők is befolyásolhatják, például magas hőmérsékleten vagy alacsony pH-n denaturálódnak.

#1

"Az aminosav az alábbiakból áll:"

A központi (alfa) szénatom kimaradt.

"Vagy lehet szó egyes esetekben konformációs változásokról."

A másodlagos és harmadlagos szerkezet kialakulása alapvetően konfomráció változásokkal történik.

"Ez nekem pl egy DNS szerkezetéhez képest, ami hélix-menetes, sokkal rendezetlenebb."

A DNS tulajdonképpen egyetlen funkciója, hogy információt tároljon, és ehhez az információhoz a sejt megfelelő időben hozzá tudjon férni. Ehhez a legmegfelelőbb egy olyan polimer, aminek a szerkezete a DNS-hez hasonlóan rendkívül egyszerű. Ez az szerkezeti egyszerűség biztosítja, azt, hogy a benne tárolt információtóhoz egyszerűen, ugyan azzal a mechanizmussal hozzá lehet férni.

A fehérjék ezzel szemben rendkívül sokrétű funkciót látnak el viszonylag kis számú egységből felépülve. Ez úgy lehetséges, hogy a szerkezet, amit a fehérjelánc felvesz nagyon változatos, így jön létre katalitikusan aktív felszín, molekuláris motor, sejtszervecséket is stabilizálni képes váz szerkezet.