A gondolataink az agy melyik részében keletkeznek, kideritették már a tudósok?

Nem tudni. Sőt, azt kategorikusan kizárhatjuk, hogy lenne egy specifikus agyterület, ami "gondolatokat termel". A gondolatok, gondolkodás egy 'emergent property', vagyis egy olyan tulajdonság, ami az agy működésének (= az egyes területek együttes összmunkájának) magasabb szintű következménye.

Kicsit olyan ez, mint pl az, hogy a víz nedves. Az is 'emergent property'. A hidrogénatom nem nedves. Az oxigénatom sem, sőt egy H2O vízmolekula sem nedves. De ha sok-sok vízatomot (szobahőmérsékleten, 1 atmoszféra nyomáson) egy edénybe beleteszel, akkor a molekulák közötti interakciók olyan mintázatot eredményeznek a fizikai és kémiai törvények miatt, aminek az lesz a következménye, hogy folyik és nedves. Tudom kicsit hülye analógia, de ez jutott eszembe hirtelen.

Nem, nem az egész agy gondolkodik.

Vannak benne különböző központok, pl. érző és mozgatóközpontok minden szervre (vannak ilyen rajzok, nézd meg). Ezek nem gondolkodnak, hanem vagy az idegi jeleket érzik meg, vagy a szerv mozgatását vezérlik.

Vannak benne más központok is, amelyek az ébrenlétet, alvást vezérlik (és érzékelik a szükséges jeleket), vagy a légzést, vagy mirigyeket, vagy pedig magának az agynak a működését.

És vannak olyan központok is, amelyek a gondolkodás valamelyik részét oldják meg. Nem egy ilyen van, hanem nagyon sok, például külön az elvont gondolkodásra is.