Van-e jelentősége annak, ha egy merevlemezt a harmadrendű SATA-portra csatlakoztatom és úgy telepítek rá Linuxot?

Azért érdekel, mert egy olyan rendszert szeretnék összedobni, ahol az egyetlen SATA III-omra csatlakozna egy SSD rajta Win7-tel, a második és harmadik SATA-portokra (amik mind SATA II-esek) egy-egy merevlemezt. Mindezt úgy képzelem el, hogy az SDD-n dolgozna az operációs rendszer, a hozzá tartozó minden adat a másodrendű SATA-portra csatlakozó HHD-n lenne és a harmadrendű SATA-portra csatlakozó másik HDD-n lenne egy teljesen különálló Linux, minden adatával együtt (tehát nem lenne szétosztva, mint a Windows esetében). Viszont beszerzési okokból egyelőre csak a Linuxot tudom telepíteni, viszont tudom, hogy SSD-re való telepítéskor csak az lehet csatlakoztatva és az is az elsőrendű portra, szóval nem tudom, mennyire lenne jó ötlet, ha most a Linuxot az egyes portra csatlakoztatva telepíteném a HDD-re, majd lcsatlakoztatnám és majd ha már telepítettem az SSD-re a Windows-t, akkor egy másikra (a harmadikra) csakúgy átdugom? A másik felmerülő kérdés, hogy mikor lehet csatlakoztatni a Windows-os adatok eltárolására használt HDD-t?