Problémát tud okozni ha az egyik merevlemez 64MB a másik meg 128MB?

Mármint a lemez cache? Nem gond.

"több helyem legyen" -- ??

Szerintem GB akart az lenni.

Nos, nem okoz problémád. Egy a lényeg, hogy legyen neki hely a gépházban, meg csatlakozóhely is.

amit írsz az a cache memória mérete. (gyorsítótár)

Amikor nagyon kis fájlokat másolsz, akkor a HDD gyorsítótárazza ezeket, ezért minél nagyobb, annál jobb. Mert hamarabb végez a másolással.

Szemmel alig észrevehető a különbség a 64 vs 128mb között, szóval ne ez alapján válassz merevlemezt.

Merevlemezeknél NEM kell sem az egyforma tárolókapacitás, sem márka, sem cache méret.

Teljesen mindegy milyen HDD-t raksz a már meglévő mellé, bekötöd, (ha kell partícionálod) formázod, és pakolod rá az adatot.