I am wondering whether I can replace - ez értelmes így? I wonder vagy I am wondering a jobb?

Nem, nem más a folyamatos/szimpla jelentése.

I wonder if I could come over today?

Nem tudom/kíváncsi lennék/azon gondolkodom, meglátogathatlak-e ma?

I am wondering if you had a job for me?

Nem tudom/kíváncsi lennék/azon gondolkodom, lenne-e munkéjuk a számomra?

A különbség nyilván ott van, ahol a Simple/Continous között általában van a jelentéskülönbség: a Continous esetében úgy általában mostanában azon gondolkodtál, hogy..., a simple esetében konkrétan most vagy kíváncsi.

hogy is fejezhetném ki:

I wonder if she is a natural blonde?

Kíváncsi vagyok, ő természetes szőke-e?

I am wondering if she is a natural blonde?

Azon gondolkodom, ő természetes szőke-e?

-> tehát a másodiknál nagyobb a hangsúly azon, hogy a gondolkodás cselekményét te most éppen végzed.

Ha mondjuk megkérdezi valaki, hogy mit állsz ott eltöprengve, tuti hogy a másodikat kell használnod.

(Az elsővel csak annyit tisztáznál, hogy valamit tudni szeretnél, nem azt, hogy most is azon gondolkodtál.)

Ha hivatalos írásban akarod használni a wonder-t: arra vigyázz, hogy ez szerény kérést/érdeklődést jelentene.

(kívéncsi lennék, hogy...azon gondolkodtam, hogy...)

Bizonyos esetekben jó lehet, de nyilván ha mondjuk írsz valakinek, hogy mikor mehetsz az új autógumikat, akkor nem ilyen stílusban írsz, hogy esetleg...ha kened is megfelel...ha nem alkalmatlan...stb.