Miért kell oxigén a kemotrófiához/-szintézishez?

A nitrifikáció kifejezetten aerob folyamat, tehát oxigén jelenlétében megy végbe. Azt nem tudom, melyik egyenletét ismered, mivel a folyamat több lépésből áll (még csak nem is egy baktérium alakítja az ammóniát nitráttá). A második lépés egyenletét úgy is fel lehet írni, hogy vízből nyeri az oxigént (tetszik érteni) a nitrit oxidációhoz a baktérium, de a magyar linkben található ábra alapján a képződő hidrogénionokat aztán oxigénnel reagáltatja, az így felszabaduló energiával alakítva ki a proton koncentráció grádienst, tehát összességében kell a folyamathoz az oxigén.

Elemi nitrogén biztos nem kell (közvetlenül) a nitrifikációhoz, mivel ammóniát (illetve nitritet) tudnak oxidálni.

[link]

[link]

[link]

Az általad felírt egyenletek messze nem teljesek (például hová lesznek az ammóniának a hidrogénjei, honnan lesz a nitritnek, nitrátnak oxigénje), a teljes egyenletek a linkekben megtalálhatóak, onnan látszik, hogy igencsak szükség van a folyamathoz oxigénre.

Ammónia származhat az elpusztult élőlények lebomlásából is például, de az igaz, hogy a bioszféra alapvető nitrogénforrása a légköri nitrogén. Azonban erre közvetlenül a nitrifikálóknak (ahogy írtad is) nincs szükségük.

"az ammónia hidrogénjei a NADP-re kerülnek"

Ez végső soron valóban igaz, de nem szerepelnek az egyenletben. Mellesleg az ammónia saját jószántából nem fogja a hidrogénjeit leadni. A töltések sem jönnek ki.

"és gondolom a koncentráció különbség miatt, az ATP-szintáz, 1 proton átengedésével szintetizál ATP-t "

Egy ATP szintéziséhez legalább három protont kell átengedni, de a folyamat alapja tényleg ugyanaz, mint a fotoszintézis esetében.

Az viszont továbbra sem értelmezhető a tankönyvi egyenletből, hogy honnan lesz az oxigén, éppen azért, mert nem teljes. De középiskolás szinten nem is kell ennél mélyebben tudni. Ha mégis érdekel, továbbra is ajánlanám figyelmedbe a fenti linkeket.