A természet feletti dolgokra, mind van tudományos reális magyaráztat vagy lehet van még olyan dolog, amit nem ismerünk?

Ez így nem igaz, mert amit ugyan nem tudunk magyarázni, de úgy néz ki, hogy beleillik az eddigi világképünkbe, vagy annak kis bővítésébe (pl. a világunk keletkezése, gömbvillám), azt nem tartjuk természetfelettinek.

A méhek repülését pedig ismerjük, mi a gond?

A természet feletti dolgokra nincs magyarázat. Ettől természet feletti. Abban a pillanatban, hogy sikerül megmagyarázni, már nem természet feletti, hanem természeti jelenség/dolog stb. mert beleilleszkedik a természeti törvények rendszerébe.

A fő kérdés az inkább, hogy ismerjük-e jól a természeti törvényeket (pl. mozgási törvények fénysebességnél, thermodinamika extrém alacsony hőfokon, stb) és hogy az összes természeti törvényt ismerjük-e. És itt bizony nagyon is hiányosak az ismereteink.

Szerintem Isten nem hisz a csodákban, mert számára jól érthető és megmagyarázható minden olyan jelenség, amit mi természetfölöttinek, vagy csodálatosnak látunk.

Ha rendelkeznénk Isten tudásával akkor nem kellene semmiféle természetfelettiben hinnünk, hiszen mindennek meg lenne az ismert oka.

Meggyőződésem, hogy Isten nem természetfeletti csak nagyon okos, Ő is része a természetnek csak mi még nem ismerjük, nem fedeztük fel.