Van valami on-line progi, ami két protein szekvenciát összehasonlít, és megmonja százalékban az eltérést?

Ja, még ez is hasznos lehet:

[link]

Ingyen tudsz felhasználót létrehozni (nem kell egyetemet meg mindenféle spéci adatot megadni, email és kész), sok programot gyűjt, továbbá hasznos, mert a szekvenciáidat is egy helyen tárolhatod.

De a BLAST is képes kettős illesztésre, ahogy a FASTA is. BLAST az NCBI honlapján (ha ismered a PubMedet, akkor tudod, ott) található, FASTA letölthető, de az előbb említett helyeken is megtalálható. (A BLAST kicsit cseles, le kell görgetni, és rákattintani a bl2seq-re, vagyis hogy két szekvenciát illeszzen.)

Nem mindegy, mekkora a szekvenciák hossza, mekkora a hasonlóság mértéke (nagyjából, ránézésre is látható ez, meg a rokonsági fokból sejthető) stb. A dotplotok grafikusan nagyon jól megjelenítik ezt, szóval előbb egy ilyen módszert ajánlok.

En a bioedit-et hasznalom. ingyenes, win alatt futo szoftver.

Kepessegei joval tulmutatnak 2 szekvencia illesztesen.