Miért vannak olyan elemek a periódusos rendszerben, amelyek csak párban fordulnak elő?

Nem teljesen világos, mire gondolsz, viszont egészen biztosan téves. Nincsenek ilyen elemek.

Esetleg arra gondolsz, hogy pl teszem azt, a hidrogén vagy oxigén, ha épp nem más elemekkel alkot vegyületet, akkor kétatomos molekula formájában szokott a természetben előfordulni? Ettől még létezik hidrogénatom önmagában, meg oxigénatom is. Csak ha épp kettő találkozik, jobban szeretnek összekapcsolódni - tudod, zárt elektronhéj, nemesgázszerkezet, amire törekszenek az atomok.

Az atomoknak van egy tulajdonsága miszerint a lehető legkisebb energiaállapotra igyekeznek, hogy alacsonyabb energiájú állapotba kerüljenek. Ezt többek között kémiai kötések kialakításával érhetik el. Leggyakrabban más elemekkel, de előfordul hogy két azonos elem alakot egy molekulát.

Ezeknek az elemeknek az egyatomos változata szinte kivétel nélkül rendkívül reaktív. Egy ilyen reaktív atom normál körülmények között nem stabil, amit találkozik gyakorlatilag bármilyen más atommal kialakít valamilyen fajta kötést. A gázok és halogének esetében ha két egyedülálló atom találkozik (a legtöbb esetben) kétatomos molekulákat alkotnak, ezzel leadva egy csomó energiát. Mivel a termék energetikailag kedvező, ezért anyagtól függő mértékben a kialakult molekula stabil lesz normál körülmények között. Így csak ezzel a formával fogunk találkozni a mindennapi éltebben.

Viszont maga a jelenség elég gyakori, sok elem alakít ki saját magával molekulákat. Többek közt a foszfor, szén, bór, kén stb... Ezek hasonló okok miatt jönnek létre, csupán az ezek keletkezésekor felszabaduló energia kevésbé jelentős ezért könnyebben felszakadnak atomjaikra.

"Pont olyan kémiai kötés alakul ki két azonos atom között, mint különböző atomok között. Szóval atomi szempontból lényegtelen a másik atom tipusa, mert csak az elektronhéjak az elektronszerkezet számít"

Hát azért ez nem igaz. Például erősen gyanítom hogy nem ugyan olyan kötés alakul ki két klór atom között és egy klór és nátrium atom közt. Valamint nem csak az elektronhéj szerkezete számít, hanem sok más tényező is az egyik ilyen az atomok elektronegativitása. Gondolom hogy valami olyasmire akartál kilyukadni hogy az atomnak tökmindegy hogy mivel köt amíg köt valamivel. De ez sem igaz így ebben a megfogalmazásba, a mit te írtál meg pláne nem.