Egy program futása jelentősen gyorsabb lehet, ha nem szedem szét függvényekre és eljárásokra a feladatot, hanem a főprogramban írom meg őket?

Elvileg igazad van. Ha az utasítások szekvenciálisan követik egymást, akkor gyorsabban fut le a program, mintha meghívnád a függvényeket, mivel azok hívásakor jmp lesz és az "idő", de a gyakorlatban ez csak rövid programnál jelent előnyt, ott meg túl sokat nem, a hosszabb programokat meg nem tudod úgy megírni, hogy függvényhívás ne legyen bennük.

Azért kizárt a dolog, mert a programot a user is vezérli, azt meg nem tudod előre, hogy hogyan.

Persze egy tömörgető progit, konvertert megírhatsz így.