Hogy tudnám a képszerkesztőben ezeket a fehér pontokat eltüntetni?

Az a gyanúm, hogy nem a megfelelő módszerrel kísérletezel.

Színkijelölésnél vagy varázspálcánál a küszöbszint állítgatásával be tudod lőni azt az értéket, amikor a pontokat is beveszi a kijelölésbe. Ezután a vödörrel „A teljes kijelölés kitöltése” opcióval színezheted át a kijelölt részt -- még jobb, ha átlátszóra törlöd, és aláteszel egy színes réteget. Képtől függően én egy kicsit meg is növelném a kijelölést, hogy egy-két pixelnyire rálógjon a logó szélére, és a Színek → Színből alfa menüponttal onnan is kiszedném az esetleg még a színbe keveredett fehéret.