Bioinformatikusok, milyen illesztő programokat használtok?
Figyelt kérdés
Adott pár tízezer read, amiket egy egész genommá szeretnék illeszteni. Ehhez keresek - lehetőleg ingyenes - programokat.2019. nov. 28. 00:06
1/4 anonim válasza:
BWA mem (Burrow-wheeler algorithm).
Human paired-end, DNA seq data.
2/4 anonim válasza:
btw "genommá" szeretnéd illeszteni?
Akkor te most de novo assemblyt akarsz? Vagy referenciához illeszteni (align)?
3/4 A kérdező kommentje:
De novo assembly-t szeretnék, igen.
2020. jan. 12. 22:28
4/4 anonim válasza:
Az attól függ hogy milyen típusú szekvenálást csináltál. (Paired-end, single end, genome/transcriptome, long read vagy short read...)
Kapcsolódó kérdések:
Minden jog fenntartva © 2024, www.gyakorikerdesek.hu
GYIK | Szabályzat | Jogi nyilatkozat | Adatvédelem | Cookie beállítások | WebMinute Kft. | Facebook | Kapcsolat: info(kukac)gyakorikerdesek.hu
A weboldalon megjelenő anyagok nem minősülnek szerkesztői tartalomnak, előzetes ellenőrzésen nem esnek át, az üzemeltető véleményét nem tükrözik.
Ha kifogással szeretne élni valamely tartalommal kapcsolatban, kérjük jelezze e-mailes elérhetőségünkön!
Ha kifogással szeretne élni valamely tartalommal kapcsolatban, kérjük jelezze e-mailes elérhetőségünkön!