Ha van egy SATA 2-es alaplapom abba belemegy egy SATA 3-as vinyó?

Igen.

Nem rontja el.

Belemenni belemegy, a kérdés csak az, hogy a vinyó tud-e a régebbi szabvánnyal együttműködni. Általában tudnak, de van néhány extrém eset, mikor a vinyó gyártója kihagyja ezt a lehetőséget a vinyó elektronikájából. Meghibásodni akkor se fog egyik sem, de ha a vinyó nem ismeri fel a szabványt, akkor nem fog tudni együttműködni az alaplapoddal.

Még annyit, hogy elvileg ha modernebb a szabvány, szokott rajta lenni jumper. Ezzel manuálisan be lehet állítani, hogy a régebbi szabványon működjön a vinyó.