A hadsereg a kormány kezében van nem?

Nem!

A kormány nem egyenlő a parlamenttel.

Nem.

A köztársasági elnök, a kormány és az országgyűlés közös felelőssége, felügyelete alatt áll.

Formailag ahogy fentebb írták, de gyakorlatilag igen, hiszen a hadügyminiszter, az államtitkárok kinevezése a miniszterelnök hatásköre, az meg öntő hatással van a hadügyminisztériumra és az összes hadügyi kérdésekre, így egy bizonyos határig a kormány akarata érvényesül.

Egyébként is 2/3 os többség esetén a Parlament is a kormány befolyása alá kerül, amint azt a gyakorlatban tapasztalni lehet, tehát vond le a következtetést magad, mennyire uralja a kormány a hadsereget.