Ha pl a pécsi buszpályaudvarra tart egy busz, és én már városon belül szállok fel rá, akkor olyan árban ad jegyet, mint egy helyijárat?

nem.

Nem tudom, hogy Pécsett is így van-e, de nálunk (Tatabányán), ha Tatabányán belül szállok fel a buszra (ugyanúgy, ha csak a buszvégig megy) akkor helyi járatos jegy árába visz el. Ráadásul, olyan árba, mintha helyszínen váltanám meg.

igen, ez változó, de legtöbbször, ha van megálló, akkor a lehető legkisebb (5-10km) útnak megfelelő díjat fogja kérni(teljes árú jegy esetén 250 Ft), mivel ugye a pénztárgép sem pontos km alapján van beállítva, hanem zónákra, így ha csak 2 km-t utazol, akkor is ennyi.